En el post anterior sobre SIBO vimos qué es, los tipos que existen y cómo se diagnostica con el test de aliento. Hoy toca la pregunta que más me habéis hecho después: y ahora, ¿cómo se trata?
Te cuento las dos grandes vías de tratamiento, los antibióticos farmacológicos y los antimicrobianos herbales, ordenados según el tipo de SIBO. También hablo del famoso efecto die off y de qué suplementos se suelen recomendar después para evitar recaídas.
Antes de empezar, algo importante: el tratamiento del SIBO lo tiene que pautar un profesional de la salud. Este artículo te sirve para entender las opciones y llegar a la consulta con información, no para automedicarte. Por eso no encontrarás dosis: dependen de cada persona y de su historial.
Los antibióticos farmacológicos
El tratamiento de referencia del SIBO es la rifaximina, un antibiótico que actúa en el intestino y apenas pasa a la sangre. A partir de ahí, el resto de la pauta cambia según el gas que predomine en tu test.
| Tipo de SIBO | Tratamiento más usado | Qué tienes que saber |
|---|---|---|
| Hidrógeno | Rifaximina sola | Es el tipo con más estudios y el que mejor responde |
| Metano (IMO) | Rifaximina + neomicina | Alternativa: rifaximina + metronidazol si no hay neomicina |
| Sulfuro de hidrógeno | Rifaximina + bismuto | El tipo más reciente y con menos evidencia |
En el SIBO de metano, la rifaximina sola se queda corta. El ensayo de referencia, del equipo de Mark Pimentel en Cedars Sinai, demostró que la combinación con neomicina mejoraba el estreñimiento y la hinchazón frente a la neomicina sola (estudio). Una revisión sistemática de 2026 confirma que es la combinación con mejores datos para metano (revisión).
En el SIBO de sulfuro de hidrógeno, el bismuto no es un antibiótico: capta el sulfuro y frena a las bacterias que lo producen. Se apoya en estudios de los años 90 y en la experiencia clínica, así que todavía queda mucho por investigar. Además, solo se diagnostica con test de tres gases, que no están disponibles en todas partes.
Un apunte práctico si vives en España: la rifaximina se vende sobre todo en comprimidos de 200 mg, una dosis distinta a la de los estudios estadounidenses, y la neomicina oral no siempre es fácil de conseguir. Por eso la pauta concreta la adapta tu digestivo.
Los antimicrobianos herbales: qué son
Los herbales son extractos de plantas con efecto antimicrobiano, como el orégano, la berberina o la alicina del ajo. Se usan como alternativa a los antibióticos o cuando estos no han funcionado, y los protocolos suelen durar entre 4 y 6 semanas, más que los 10 a 14 días del antibiótico.
El estudio que les dio credibilidad se hizo en Johns Hopkins en 2014. Comparó rifaximina con dos fórmulas herbales durante 4 semanas: el test se normalizó en el 46% del grupo herbal frente al 34% del grupo con rifaximina, sin diferencia significativa entre ambos (estudio). Además, más de la mitad de quienes no respondieron a la rifaximina dieron negativo después con los herbales.
Ahora bien, conviene saber sus límites:
- La evidencia es más limitada que la de los antibióticos: estudios pequeños y sin comparar unas plantas con otras.
- No hay estudios específicos para metano. La clasificación por tipo de SIBO que te explico abajo viene de la experiencia de especialistas, no de ensayos.
- Natural no significa inocuo. La berberina interactúa con muchos medicamentos y baja la glucosa, y varias plantas están desaconsejadas en el embarazo.
También hay datos españoles: un ensayo publicado en 2024, en el que participó el Hospital de Sagunto, vio que añadir fitoterapia y probióticos al antibiótico y la dieta no mejoraba el resultado del test, pero sí los síntomas a medio plazo, sobre todo en el SIBO de metano (estudio).
Qué herbal se recomienda para cada tipo de SIBO
La regla general es sencilla: orégano y berberina para hidrógeno, alicina para metano. El resto de plantas se reparten según la experiencia de especialistas como Nirala Jacobi o Allison Siebecker (The SIBO Doctor).
| Planta | Hidrógeno | Metano | Notas |
|---|---|---|---|
| Alicina (extracto de ajo) | Poco | Principal | La referencia para metano; el extracto no lleva los fructanos del ajo |
| Quebracho y castaño de Indias (Atrantil) | Leve | Sí | Frenan la producción de metano; alternativa sin ajo |
| Neem | Sí | Sí | De las pocas que cubren ambos gases |
| Orégano | Principal | Parcial | El carvacrol es su parte activa |
| Berberina | Principal | Débil sola | Para metano, siempre combinada |
| Tomillo | Sí | No | Suele ir junto al orégano |
| Clavo | Sí | No | También antifúngico |
| Artemisia annua | Sí | No | No confundir con el ajenjo |
| Ajenjo (Artemisia absinthium) | Probable | Sin datos | Lleva tuyona: evitar en embarazo y tomas largas |
| Comino negro | Sin datos | Sin datos | Antimicrobiano general, poca evidencia en SIBO |
| Pau d’arco | Sin datos | Sin datos | Se usa sobre todo como antifúngico |
¿Y para el SIBO de sulfuro de hidrógeno?
Aquí la base cambia: plantas sin alicina, como orégano, neem o berberina, solas o en mezcla, más algunos minerales que ayudan a manejar el sulfuro. Las bacterias que fabrican sulfuro también se alimentan de hidrógeno, por eso se parte del protocolo de hidrógeno con pequeños ajustes (Kresser Institute).
Por qué sin alicina. La alicina y el resto de compuestos del ajo son compuestos azufrados: moléculas que llevan azufre en su estructura. Las bacterias del sulfuro usan precisamente ese azufre como materia prima para fabricar su gas. Por eso, en este tipo de SIBO muchos profesionales evitan el ajo, la cebolla y suplementos ricos en azufre como la NAC, y algunos proponen una dieta baja en azufre durante el tratamiento, como el herbolario Eric Yarnell (The SIBO Doctor).
Los apoyos que se añaden y por qué:
- Es el más importante. Reduce la producción de sulfuro y a las bacterias que lo generan, y potencia el efecto del resto del tratamiento. Se puede añadir a cualquier protocolo, sea con antibiótico o con herbales (SIBO Info).
- Es un mineral que el cuerpo necesita para transformar el sulfito en sulfato, una forma que sí puede aprovechar. Cuando falta, el sulfito se acumula y puede empeorar los síntomas.
- Zinc (en forma de acetato de zinc). El zinc se une al sulfuro y reduce su cantidad, así que ayuda a neutralizar el gas mientras dura el tratamiento.
Ten en cuenta que el subsalicilato de bismuto lleva salicilato, de la familia de la aspirina, y no es adecuado si tomas anticoagulantes o eres alérgica o alérgico a la aspirina. El zinc, en tomas largas, puede bajar el cobre. Por eso estos apoyos se usan durante un tiempo concreto y con seguimiento profesional.
¿Intolerante al ajo? Depende de qué te siente mal. Si es por los fructanos (lo más habitual), la alicina en extracto suele tolerarse bien. Si reaccionas incluso al aceite de ajo, mejor elige Atrantil o neem.
Qué tienen en común y cómo se combinan
Antibióticos y herbales siguen la misma lógica: un tratamiento para el gas que predomina y otro para el que lo acompaña. Por eso casi nunca se usa un solo producto.
El motivo está en cómo funcionan los gases. Los microorganismos que fabrican metano se alimentan del hidrógeno que producen otras bacterias. Si solo atacas el metano, el hidrógeno puede “aparecer” después; si solo atacas el hidrógeno, el metano sigue ahí.
Así se traducen las combinaciones farmacológicas a herbales:
| Tipo de SIBO | Antibióticos | Equivalente herbal |
|---|---|---|
| Hidrógeno | Rifaximina | Berberina y/o orégano |
| Metano o mixto | Rifaximina + neomicina | Alicina o Atrantil + berberina, orégano o neem |
| Sulfuro de hidrógeno | Rifaximina + bismuto | Orégano, neem o berberina (sin alicina) + bismuto, molibdeno y zinc |
Las combinaciones herbales para metano de la tabla son las que propone Siebecker en su protocolo (SIBO Info). Las fórmulas comerciales con varias plantas a la vez suelen estar pensadas para hidrógeno: antes de comprar, revisa si llevan algo específico para metano.
Y en ambos casos, lo más importante: repetir el test de aliento al terminar. Es la única forma de saber si el tratamiento ha funcionado.
¿Solo herbales, solo antibióticos o los dos a la vez?
Lo habitual es elegir una vía, repetir el test al terminar y, si no ha funcionado, cambiar a la otra. Tomar antibióticos y herbales a la vez no es el planteamiento estándar.
| Antibióticos | Herbales | |
|---|---|---|
| Duración | 10 a 14 días | 4 a 6 semanas, a veces 8 en metano |
| Evidencia | Más estudios y ensayos | Menos estudios, más experiencia clínica |
| Receta | Sí | No, pero conviene supervisión |
| Cuándo se eligen | Primer tratamiento, valores de gas muy altos | Si el antibiótico falló, por preferencia o para repetir ciclos |
Uno detrás de otro, no a la vez. El esquema de Nirala Jacobi lo resume bien: tratamiento, test de control y, si la mejoría es parcial, cambiar de antimicrobiano, repetir la rifaximina o valorar la dieta elemental (The SIBO Doctor). Siebecker recomienda repetir el test si no hay una mejoría clara en las dos semanas siguientes, y recuerda que a menudo hacen falta varias rondas (Natural Medicine Journal).
Los herbales como plan B tienen datos. En el estudio de Johns Hopkins que te contaba arriba, más de la mitad de quienes no respondieron a la rifaximina dieron negativo después con herbales. Y como se toleran bien, son la opción más usada para repetir ciclos cuando el SIBO vuelve.
¿Y combinarlos a la vez? Hay poca evidencia. El ensayo español de 2024 añadió fitoterapia y probióticos al antibiótico y la dieta: no mejoró el resultado del test, aunque sí los síntomas a medio plazo, sobre todo en metano. Así que, si se combinan, que sea porque lo decide tu profesional.
La excepción son los apoyos que no son antimicrobianos, como el bismuto en el SIBO de sulfuro, que sí se suman a cualquiera de las dos vías.
El efecto die off: por qué a veces te sientes peor al empezar
El die off (también llamado reacción de Herxheimer) es un empeoramiento temporal de los síntomas al empezar el tratamiento. Ocurre porque, al morir muchas bacterias a la vez, liberan sustancias que tu cuerpo tarda un poco en eliminar.
Los síntomas más habituales, según la experiencia clínica de Siebecker, son hinchazón, cansancio y dolor de cabeza (SIBO Info). También puede aparecer niebla mental, malestar general parecido a un catarro, o un cambio en el ritmo intestinal.
Cuánto dura: suele empezar a los pocos días de iniciar el tratamiento y ser más intenso al principio, aunque en algunas personas dura todo el tratamiento.
Dos ideas que conviene tener claras:
- No tener die off no significa que no funcione. Mucha gente no lo nota en absoluto, aunque tenga valores altos de gas.
- Tenerlo tampoco significa que funcione mejor. La intensidad del die off no está relacionada con el éxito del tratamiento.
Qué ayuda:
- Empezar despacio. Con los herbales, muchos profesionales suben la dosis de forma progresiva para evitarlo.
- Beber suficiente agua y descansar los primeros días.
- Cuidar el tránsito intestinal. Con estreñimiento, el die off suele ser peor, porque se eliminan peor esas sustancias.
- Consultar antes de cambiar nada. Si los síntomas son intensos, tu profesional puede ajustar la pauta.
Eso sí, no todo empeoramiento es die off. Si tienes fiebre alta, dolor intenso, sangre en las heces o un síntoma que te preocupa, consulta con tu médico sin esperar.
Después del tratamiento: suplementos para evitar recaídas
El SIBO tiene fama de volver, y por eso lo que haces después del tratamiento importa tanto como el tratamiento en sí. Estos son los apoyos con más respaldo, de más a menos importante.
- Procinéticos: el pilar para no recaer. Son sustancias que ayudan a que el intestino delgado se “barra” solo entre comidas. Pueden ser farmacológicos, con receta, o herbales, como el jengibre o algunas fórmulas de plantas. Un metaanálisis de 2025 situó la combinación de rifaximina con un procinético como la opción más prometedora en personas con SIBO y colon irritable (metaanálisis).
- Probióticos: sí, pero con matices. Un metaanálisis de 2017 encontró que tomarlos mejoraba la eliminación del SIBO y reducía el dolor abdominal, aunque no evitaba que volviera (metaanálisis). Las cepas más estudiadas son Saccharomyces boulardii y Bacillus clausii. No a todo el mundo le sientan bien: si notas que empeoras, déjalos.
- Goma guar parcialmente hidrolizada (PHGG). Es una fibra suave que suele tolerarse bien con SIBO. En un ensayo italiano, añadirla a la rifaximina subió la eliminación del SIBO del 62% al 85% (estudio).
- Reparar la mucosa intestinal. Después del tratamiento se suelen usar L-glutamina y zinc carnosina para ayudar a regenerar el intestino. La evidencia es menor, pero son apoyos habituales en esta fase.
- Volver a comer de todo. La dieta baja en FODMAPs ayuda durante el tratamiento, pero no es para siempre. Después toca reintroducir alimentos poco a poco, porque una dieta variada alimenta a las bacterias buenas.
Y sobre todo, buscar la causa: si algo favoreció el SIBO (tránsito lento, hipotiroidismo, ciertos medicamentos), tratarlo es lo que de verdad evita que vuelva.
Para terminar
Si tuviera que quedarme con tres ideas, serían estas: el tratamiento depende del tipo de gas, cada protocolo combina un antimicrobiano para el gas principal y otro para el que lo acompaña, y lo que haces después es clave para que el SIBO no vuelva.
Y una cuarta: ni los antibióticos ni las plantas sustituyen a un buen diagnóstico. Lleva tu test de aliento a la consulta y decide el tratamiento con tu médico o profesional de la salud.
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Este artículo es divulgativo y no sustituye el consejo médico. No tomes antibióticos ni suplementos sin supervisión profesional, sobre todo si tomas otros medicamentos, estás embarazada o tienes alguna enfermedad.
Fuentes
- Pimentel M, et al. Antibiotic treatment of constipation-predominant irritable bowel syndrome. Digestive Diseases and Sciences, 2014.
- Antibiotic therapy for small intestinal bacterial overgrowth: a systematic review. Frontiers in Pharmacology, 2026.
- Chedid V, et al. Herbal therapy is equivalent to rifaximin for the treatment of SIBO. Global Advances in Health and Medicine, 2014.
- Gallén A, et al. Do herbal supplements and probiotics complement antibiotics and diet in the management of SIBO? Nutrients, 2024.
- Zhong C, et al. Probiotics for preventing and treating SIBO: a meta-analysis. Journal of Clinical Gastroenterology, 2017.
- Furnari M, et al. Rifaximin with partially hydrolysed guar gum vs rifaximin alone. Alimentary Pharmacology & Therapeutics, 2010.
- Zhang Q, et al. Comparative efficacy of therapeutic regimens for SIBO: a network meta-analysis. Therapeutic Advances in Gastroenterology, 2025.
- Siebecker A. SIBO Info: protocolos herbales y die off.
- Jacobi N. SIBO, IBS and herbal medicine (The SIBO Doctor).
- Kresser Institute. Gut Treatment: SIBO review.


